Es un organismo con fines académicos en el cual están representados los más importantes elementos de la Comunidad Educativa Universitaria, está presidido por la Rectora de la Institución  y como Secretario actuará el Secretario General.

Los miembros que integran el Consejo Superior Universitario son los siguientes:

1.   Rectora: Licda. MAE. Judith Virginia Mendoza de Díaz

2.   Secretario General: Lic. Julio Eduardo Meléndez Núñez

3.   Decana de la Facultad de Ciencias Económicas: Licda. MAE. Vilma Anabella Martínez Flamenco.

4.   Decana de la Facultad de Ciencias y Humanidades: Licda. MAE. Blanca Luz Guzmán de Duarte.

5.   Decano de la Facultad de Jurisprudencia y Ciencias Sociales: Lic. Msc. Mauricio Antonio Vásquez López.

6.   Representante del Sector Docente: Licda. Elda Ruth Villalta Mena.

7.   Representante de los Centros Universitarios: Licda. Med Claribel del Carmen Calderón de Mendoza

A este organismo le corresponde actuar de manera directa sobre todos los aspectos académicos de relevancia que sean requeridos  por la Comunidad Educativa: los estudiantes, los docentes, las autoridades académicas, sean estas colegiadas y/o individuales.

Entre las funciones más importantes que posee el Consejo Superior Universitario se encuentran:

Conocer y aprobar los Planes y Programas de Estudios presentados por el Rector a propuesta de los Decanos de las Facultades, previa su presentación y aprobación conforme a la Ley de Educación Superior:

	Fijar los aranceles universitarios por matricula, derechos de exámenes, anualidad y otros;
	Conocer de los nombramientos de los Directores de los Centros Regionales y otras autoridades administrativas;
	Discutir los presupuestos y sus reformas, los cuales deberán ser presentados por el Rector previamente  de ser sometidos a conocimiento y aprobación de la Junta de Directores;
	Autorizar el otorgamiento de Títulos Honoris Causa
	Elegir al representante del profesorado ante el Consejo de Facultad